
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
深入分析效果
研究探讨相关人员实验设计跟随着冷冻箱耗时延长至时候羊肉的对抗强度、持混流式水轮机、汤色、分离铁硫纯度、ROS、脂质过空气铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4技术水平来开展肩部肌肉团体细胞系膜的铁死掉心态。数据表示,冷冻箱耗时延长至时候后,羊肉的对抗强度在第8天和第6天相关系数骤降;持水功能降低;颜色搭配变深,逐渐耗尽有光泽,鲜粉红色的调成暗粉红色的。虽然,分离铁、灵活性氧和MDA的硫纯度相关系数增高,细胞系膜凋亡率相关系数身高。 研究探讨考生添加有所性别差异的食品冷藏耗时的力量样本的胆固醇酶质,其次实行SDS-PAGE概述,胆固醇酶质条带在有所性别差异的一时期规划不均且同类(图1a)。会根据胆固醇酶在有所性别差异的样本中的展示情形,概述感觉相同的组样本的中五位数达到于相同的级别(图1b),说明怎么写力量样本胆固醇酶质体现了充分的组内同类性和组间性别差情人。 核球核球蛋白酶质含量组学共签定出1996种核球核球蛋白酶质含量。以B0为差表组,筛分B1、B2、B4和B6中的核球核球蛋白酶完成各种之处展现浅析,共签定到375个DEPs。将火山图可视化效果,并给出FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两大准则浅析DEP。效果如图图示1c-f图示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别签定出22、33、73和140个DEPs,这之中别上涨6、11、32和84个,调低16、22、41和5多个。聚类分析方案鉴定了各种保鲜时段健身胸肌组建中核球核球蛋白酶质含量的展现,效果凸显健身胸肌核球核球蛋白酶展现各种之处随着时间间隔的推移存贮时间间隔的加剧而加剧(图1g)。
图1| 的不同保鲜冷库精力的腹肌样本高蛋白质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于冷冻冷藏期限的健身肌肉样机性别差异蛋清数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁意外死亡球蛋白肽的PRM化学发光法概述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG生物富集差异性抒发血清的铁死措施(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT定量分析血清质组学技术性工艺售后服务保障,拜谱生物技术性已技术性创新完工并建造了全面早熟的转录组学、血清组学、分泌组学或两组学连合护肤品技术性工艺售后服务保障体系中,欢迎致电咨询!
分类论文文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.