
图片背景说明
建设人们策划 的表观遗传表达爱图谱常异常于的健康样板的更改。之前的学习多利用脑死捐赠者或病理报告去除策划 旁的"临近普通 "策划 ,但哪些样板长期存在坏死、分解失衡或妇科疾病微自然环境打扰等现象。2026年4月,国际顶级期刊《Nature》发表了题为“A spatial atlas of the healthy human liver from live donors”的突破性研究,该研究通过前景转录组学(Visium、Visium HD、MERFISH和PhenoCycler 成像)与单血细胞质RNA测序(snRNA-seq)的深度整合,系统揭示了活体健康人肝的空间表达蓝图,并发现人类肝脏中央区功能相较于小鼠及其他哺乳动物存在明显差异。本研究为健康人类肝脏提供了空间基因表达参考框架,并深入揭示了早期脂肪变性过程中肝细胞的变化机制。
区域空间转录组学
阐述活体的健康供肝的独家转录组的特征
研究团队首先通过Visium面积转录组学系统解析了16例肝脏样本的转录组特征,包括8例活体健康供肝(LHD)和8例病理旁"邻近正常"组织。在44,243个高质量spots中,研究发现活体健康供肝与邻近正常组织在伪批量表达谱上明显分离:健康供肝高表达肝细胞功能基因,包括尿素循环酶(ASS1)、药物代谢酶(CYP2E1)和糖异生基因(PCK2);而邻近正常组织则高表达免疫相关基因(S100A8、S100A9)和应激基因。线性混合回归模型显示,"模板类行"是基因遗传表答遗传变异的重要驱动软件条件,其效应超过年龄、性别和组织学评分。这一发现警示:传统病理旁"正常"组织可能存在系统性偏差,活体健康供肝才是建立真正健康参考标准的理想选择。
图1 人类进化和母乳喂奶软体动物胰腺的室内空间把你想表达出来图谱
Visium HD & MERFISH
重新构建肝小叶门门静脉
中心地方门静脉轴的协调系统分区图谱
利用CYP2E1等标志基因构建分区指数,研究团队将肝小叶划分为5个层次性。在1,724个肝细胞特异性基因中,1,144个(66%)主要表现出有效的系统分割差异性。中央静脉区富集外源物质代谢(CYP2E1)、胆汁酸合成(CYP27A1)和脂质合成(FASN)基因;而门静脉区则高表达免疫相关基因(CRP、SAA1)和经典糖异生基因(PCK1)。冲破性发掘:人类特有的线粒体糖异生基因PCK2和葡萄糖转运蛋白GLUT2(SLC2A2)均呈中央静脉区富集,单独试炼了一般来说糖异生只能门动脉区的角度。Visium HD与Visium数据验证这些分区模式(Spearman R=0.70,P<10⁻³⁰),MERFISH在500个基因上进一步独立验证了分区模式。
图2 肝血细胞遗传基因呈现磁盘分区
跨鱼类室内空间转录组学
具体分析人肝区分模式英文的种类特异形
研究团队生成小鼠(n=6)、野猪(n=2)、家猪(n=3)和牛(n=2)的空间转录组数据,进行系统比较。主要结论:人与小鼠的分区偏倚相关性较低(R=0.15,P=5.18×10⁻²⁵),存在大规模功能偏移。人类中央静脉区显著富集尿素循环酶(OTC、ASL、NAGS)、脂肪酸合成酶(FASN)及转录因子HNF4A(在小鼠中为门静脉区富集),而这些功能基因在小鼠中多呈门静脉区富集。更意外的是,与猪、牛等大型哺乳动物相比,人肝中央静脉区功能多样性仍显著更高。尽量WNT移动信号信号通路的分离模试在因此动物群中保手,但人类祖先军委区功能模块的独特性移位也许由分解代谢率、雄激素均值等动物群活性聊天原则推动,提示小鼠模型在研究人肝脏代谢疾病时可能存在系统性局限。
图3 辅乳宠物之間显著和同时的分区域方法
snRNA-seq & Visium HD
解读非本质上细胞核的位置区域及互作wifi网络
通过snRNA-seq(67,000+个細胞核)结合Visium HD空间定位,研究团队构建了成纤维细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞等非实质细胞的分区图谱。与小鼠有差异 ,人肝Kupffer生殖细胞呈中央军事区丰度,可能与其清除高代谢活性中央区死亡肝细胞的功能相关。进一步分析发现多个分区特异性配体-受体互作对:中央区LSECs来源的WNT2与肝细胞FZD5及成纤维细胞FZD1受体互作;成纤维细胞和LSECs表达的RSPO3与肝细胞LGR5和LGR4受体共分区。这些结果为理解肝内分区特异性信号通讯提供了重要资源。
图4 肝胀非其实质内部的区分
刷卡机深造&两组学资源整合
阐明最早的时候蛋白质性质发生变化中的线粒体代偿灾难
在表现为轻度脂肪变性(<20%)的健康供肝中,MASLD 脂质积累起始于中央静脉区。研究团队利用广州POS机学对H&E图象做好分辩率级脂滴化学发光法,将中央静脉区spots按脂质含量分为5个梯度。结果显示:随着脂质增加,脂质摄取/合成基因(SLC27A3、DGAT1)下调,而β-氧化(DIO1、HSD17B4)和脂质分泌(ABCB4)基因上调——提示肝细胞试图通过增强线粒体氧化能力限制脂质堆积。关键提示:核编码线粒体蛋白基因(如NDUFA9、NDUFS4、NDUFS8)表达下降,而线粒体自身编码的RNA(MT-ND1、MT-ND4L)却代偿性上升。这种核-线粒体基因表达失衡可能是未来脂毒性的潜在机制之一,为MASLD(代谢相关脂肪性肝病)早期干预提供了全新靶点。
图5 肌肉退行肝细胞膜基因遗传表明的动图变迁
拜谱个人心得体会
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参照资料
Yakubovsky O, et al. A spatial atlas of the healthy human liver from live donors, Nature (2026), //doi.org/10.1038/s41586-026-10377-y