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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网上药理学学论述草酸钙肾结石脱色应激状态和发炎断裂原则

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿控制系统最先见的症状之1。肾聚集中CaOx尖晶石过呈现饱和状态的堆积会引发肾小管细胞膜神经损伤和凋亡,以此引发肾结石的生成。短链脂质含量酸由可以使肠胃内厌氧腐熟细茵腐熟营养饮食玻纤引发,不在身体局部可以使肠胃深层中充分充分调动功效,还在控制系统横向上也充分充分调动的关键功效。至少,丁酸是最充足的短链脂质含量酸,具消除炎症和抗体压制功效,本学习研究方案丁酸对CaOx肾结石的功效下列不属于潜在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医生泌尿五官科吴忠院士生导师、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健硕士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了手机网络药理学学工作,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

短文名稱:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 雇主的单位:华山诊所 调查因素:大鼠、HK-2受损细胞 组群的信息:差表组(Con)、建模组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱能提供方法:网上药学学检查测量

思维程序程序流程图

研究分析的结果

设计人数前提是建设大鼠绘图,顺利通过顺利生物化质量指标和组织化病理学学复染等设计方法感觉丁酸能够 缩短CaOx绘图大鼠肾CaOx结晶的演变成和板材损害,提高CaOx绘图大鼠的炎症病变板材损害和腐蚀的物质的过快表示。因此,丁酸还可限制草酸引诱的HK-2神经元板材损害、腐蚀应激状态和神经元凋亡。 为定量研究分析一下丁酸格局和靶人类人类dna组组微信网上,定量研究分析一下涉及到的人员从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和三维空间格局(图1A)。在PharmMapper的数据资料统计库和Uniprot的数据资料统计库解决后共需求出115个丁酸靶人类人类dna组组供进1步定量研究分析一下。将人类人类dna组组全部倒入STRING的数据资料统计库,参与到PPI微信网上定量研究分析一下。Cytoscape拿到了排名的前20的核心区靶人类人类dna组组的祥细微信网上图,其中包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这种核心区人类人类dna组组与微信网上中的的人类人类dna组组均展现出有一定的涉及到的性,显示这种人类人类dna组组也许充分表现着一体化的功效。GO和KEGG定量研究分析一下显示了丁酸核心区人类人类dna组组的涉及到的路线和微生物体学的功能(图1C)。核心区人类人类dna组组主耍与类固醇的性激素回应、钝化应激生理反应响应回应、可溶性氧血细胞对类固醇的性激素刺激性的响应已经对呈酸性微生物学物料的响应相关的。综上根据上述根据上述,这种核心区人类人类dna组组主耍参与到了钝化应激生理反应响应和对可溶性氧的微生物体响应过程中 ,是肾结石建成体制中至关关键的路线,这显示丁酸也许在肾结石中充分表现关键的功效。

图1| 丁酸组成部分与靶染色体wifi网络概述(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部挑战丁酸对CaOx肾结石真是切靶表观遗传遗传,论述员根据GEO信息库对GSE73680中安全健康较与CaOx肾结石人群的表观遗传遗传异同展开了论述。较组与CaOx结石人群的偏态性异同呈现表观遗传遗传(DEGs)塞查基准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个表观遗传遗传形成偏态变迁,各举3379个(89.4%)表观遗传遗传呈现调涨,404个(10.6%)表观遗传遗传呈现下降(图2A)。对DEGs展开聚类分析法浅析法浅析,热图表现了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析法浅析法表现(图2B)。后来,论述员依据GeneCards信息库人工成本鉴定会了370个可以与CaOx肾结石涉及到的的表观遗传遗传,排行前20位的推测表观遗传遗传还有涉及到的性评级如2C右图。是为了查找丁酸诊治CaOx肾结石的关键点靶点,论述员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到的表观遗传遗传清理受到新一个Venn图。之后,CYP2C9被明确为丁酸功用CaOx肾结石的隐藏的靶点(图2D)。最后,论述员还展开了丁酸与CYP2C9的碳原子项目对接,CYP2C9的三大胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间功用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用无线网络临床药理学估计CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶DNA后,探析拜谱生物还在生殖细胞核实验所查证了CYP2C9可减低草酸引诱的HK-2生殖细胞核的ROS情况、慢性炎症伤到和凋亡。

图2| 大部分据库聯合浅析预侧CYP2C9是丁酸角色于CaOx肾结石的靶表观遗传

设计没想到

本探索先要发觉丁酸在身体之外和内部均能促使CaOx肾结石类别的脱色应激状态状态和支原体感染拉伤,紧接着根据网格临床临床药理学淘汰取到丁酸干扰CaOx肾结石的潜在性的靶点——CYP2C9,后面根据血受损细胞实验英文印证CYP2C9在草酸盐分析的HK-2血受损细胞ROS含量、支原体感染拉伤和凋亡。这部分发觉认为丁酸很有可能根据促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的脱色应激状态状态,可减轻支原体感染拉伤。某一期间中拜谱菌物保证了网格临床临床药理学新技术性服务培训于,还有拜谱菌物可增进成长逐步完善的DNA组学、淀粉酶质组学、细胞代谢组学等两组学產品及新技术性服务培训于,欢迎语打电话询问! 符合论文文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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