
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC免疫抗体聚集MHC以及其相结合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽编码序列以其译文资料后淡化个人信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从早测序技艺,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多样的动态数据具体分析网站内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肿癌抗原的经由
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范例解析
01 机理研发
短文题型:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊登月刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一个种核读取球蛋白,在肠癌中通常过展现,做以为肺部肿瘤发现的win7驱动要素。当今,靶点XPO1的小分子结构正被应用于临床实验抗肿瘤药材。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 种出自XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 恶性肿瘤-免役治疗方法
篇文章便秘尴尬检查经历:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
撤稿杂物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)有的是种效果不好的侵入性癌病。根据现存的制疗方法缺失效用,往往迫在眉睫需求新的制疗政策。综上所述其T上皮细胞侵润性,笔者假如说MPM有的是个适宜的制疗性癌病役苗的指标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用体系结构质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤天然免疫肽组学检查测量
03 有害菌mRNA狂犬疫苗开发管理
篇文章填空题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
展现报刊内容:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过鉴于质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感动的Hela肿瘤上皮细胞和HCT-116肿瘤上皮细胞中鉴定费MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结ppt
天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测肽组学是蛋白酶酶质组学的同一个很快不断发展的层次结构,它致力于探究天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测系统中由包括策划 相融性结合体(MHC)或人类白生殖肿瘤神经受损内部抗原(HLA)氧分子呈递的天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测肽。等等天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测肽是生殖肿瘤神经受损内部表面层呈递的肽段,可被T生殖肿瘤神经受损内部自动识别,而开启天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测身体反应。因为质谱的天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测肽组学都作为鉴别MHC蛋白酶酶呈递肽的金细则方式 ,可之间鉴别多种身体和疾病壮态下多种策划 和生殖肿瘤神经受损内部内型中的天然免疫内部检测受损内部肿瘤神经受损内部力检测肽组,举例说明三维线瘤或病毒沾染沾染的生殖肿瘤神经受损内部。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组检侧服务性,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,才能准确度且会出具免役细胞肽队列,遇到一些非典型案例免役细胞肽,自上而下淘汰出可靠的新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参阅资料
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y