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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

不停最为蓝翔塑业有限公司所生产的辅料而被所知的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“细胞代谢废料”为“寻宝小原子核”的苦不堪言发展史类似的,也许近十多年才被找到其注重的生物制品学功能表,终究“翻盘农奴把合唱”,尤其是在免疫细胞发炎性慢性病探索方面内独树一帜。就有好几篇本文新闻稿了在繁多发炎性慢性病的家禽3d模型中索取衣康酸或其电化学呈现双重性物制品的进行治疗益处,并找到其隐藏靶点。针对衣康酸的“上一世”与“这辈子”,详情微信文章《乳酸的逆袭吧盟兄弟——衣康酸!篇文章与你详细了解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化遮盖蛋白质组学产品,实现1000+什么难以理解的度装饰位点验出,安稳显现经典传奇靶点,全定位生信分折解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“知道”到“查证”全流量的服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实践的流程

02、场地实测数据资料

03、经“点”显现

在测评数据源中,验出很多个论文中新闻稿的經典靶点各种其衣康酸淡化语位点,如独一名被挖掘的衣康酸共价淡化语核球血清KEAP1,有着糖酵解信号通路中的3个核心酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各种炎性小体组合成核球血清NLRP3和神经元损伤过程中 中的核心核球血清RIPK3等,其质谱图下面图图示。

04、产品的特性

1.丰富质控

商务化特异形电极孵育、SDS-PAGE的加测、WB手机验证、样版相应的性定性分析等各八卦方位的加测,加强组织领导工程但是正规性。

2.强性能指标质谱检测设备机构

在Orbitrap Astral全一代名将高识别质谱仪作明佛母心咒下,变现衣康酸性反应呈现位点及蛋白质检验新的深度,保驾护航有效探究新发展。

3.全步骤站台式服务培训

由于拜谱菌物成熟的工作公司,可展示 “血细胞培养计划→在线在线检测器孵育→WB在线在线检测→高妙度衣康硝化作用修饰语在线在线检测→属于生信数据分析→特定的位点PRM认可”全过程精准服务,省时省劲、方便更好些。

05、了解信息内容(环节)

06、应该用方面

PART 2、文章分享和交流

文献综述一

日语版头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

英文版宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研究方案知识:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文献资料二

英文字母子标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

钻研的内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、事例随之出现想法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13享有具有的底物结合起来效果,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康硝化作用绘制组测量统计数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用突显(以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

当做TCA配置中的上面消化吸收物,衣康酸的调节消化吸收、抗体检测和感染彼此的能够 目的,为诊治抗体检测感染性慢性病打造了替换诊治方法。衣康酸框架中的亲电性α,β-不过饱和羧酸框架能对蛋清质上的灵活性半胱氨酸残基开展烷基化淡化(迈克尔暴击伤害响应),一项译为后淡化被称之为“衣康酸淡化(itaconation)”,从而干扰蛋清质用途,调节作用抗体检测对答和消化吸收手段,为几种慢性病药材研究开发打造新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸突显球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学绝对化一定量靶向疗法排泄组(QMT1000)或热量细胞产生靶向疗法细胞产生组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

关联性资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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